Dans les hauts plateaux semi désertiques du Nord, iguanes et crotales cohabitent avec les scorpions, les rongeurs et les coyotes, tandis que les rapaces dominent les cieux.

Dans les montagnes du Centre et de l'Est, les pumas et les mouflons préfèrent les hauteurs peu accessibles, tandis que la forêt tropicale bruisse d'une grande variété d'oiseaux, de singes, de reptiles et d'insectes. Le jaguar et le quetzal, deux animaux mythiques pour les civilisations précolombiennes, se font rares.

Aux environs d'Ocampo, à l'est de Morelia (Michoacan), on peut assister, en novembre, au spectacle de la migration annuelle de millions de magnifiques papillons monarques, qui couvrent les arbres d'orange vif.

Il est également possible d’apprécier dans la basse Californie l’enchanteresse saison des amours des baleines grises.

La tortue Luth vient pondre ses œufs sur la cote du pacifique comme de l’atlantique.